妙手醫(yī)生
作者:李勇 北京市朝陽(yáng)區(qū)六里屯社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心(北京城建老年病醫(yī)院)
對(duì)Ru(II)配合物與BSA進(jìn)行了電子吸收和熒光發(fā)射光譜研究與DNA結(jié)合方法相似,只是使用BSA代替CT-DNA。
抗菌和抗氧化評(píng)價(jià)采用3種革蘭氏陰性(大腸桿菌、傷寒沙門(mén)氏菌和銅綠假單胞菌)和3種革蘭氏陽(yáng)性(黃體微球菌、枯草芽孢桿菌和巨芽孢桿菌)采用良好擴(kuò)散法對(duì)所有合成的化合物進(jìn)行抗菌活性檢測(cè)。簡(jiǎn)而言之,將大約20 mL的營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基倒入經(jīng)過(guò)消毒過(guò)的培養(yǎng)皿中。細(xì)菌試驗(yàn)菌在營(yíng)養(yǎng)肉湯中培養(yǎng)24 h。采用各細(xì)菌微生物培養(yǎng)50 μL的營(yíng)養(yǎng)肉湯培養(yǎng)液(1×105 CFU/mL)制備細(xì)菌草坪。用消毒的不銹鋼軟木鉆制備了直徑為5毫米的瓊脂孔。將所有化合物溶解在DMSO中,得到1 mg/mL的原液。每個(gè)孔裝載100 μL,二甲亞砜(DMSO)為陰性對(duì)照,鏈霉素(DMSO中的100μg)為陽(yáng)性對(duì)照。將培養(yǎng)皿在37°C下孵育24小時(shí),并檢查是否存在抑制區(qū)。測(cè)量抑制區(qū)直徑,記錄每個(gè)生物體的平均值,并以毫米為單位表示。采用肉湯稀釋法測(cè)定MIC(最低抑菌濃度)。
DPPH清除%eT?Ao樣本=Ao100,其中Ao是對(duì)照反應(yīng)的吸光度,樣本是樣品的吸光度??箟难岜徽J(rèn)為是其已知的抗氧化活性的陽(yáng)性對(duì)照,也被平行測(cè)試。MTT測(cè)定法標(biāo)準(zhǔn)-二甲基噻唑)二苯基四唑溴化銨測(cè)定程序采用。將細(xì)胞放置于96孔微檢測(cè)培養(yǎng)板中(每孔8×103個(gè)細(xì)胞),在5%二氧化碳培養(yǎng)箱中在37°C下培養(yǎng)過(guò)夜。將配合物在DMSO中溶解,用RPMI 1640稀釋?zhuān)尤肟字?,最終濃度在10?6~10?4m之間。添加培養(yǎng)基(100 μL)制備對(duì)照孔。用含有不含細(xì)胞的培養(yǎng)基的孔作為空白孔。培養(yǎng)皿在5%二氧化碳培養(yǎng)箱中以37°C孵育48小時(shí)。孵育完成后,在每孔中加入原液MTT染料溶液(20 μL,5 mg/mL)。4h后,加入含有N、N-二甲基甲酰胺(50 %)和十二烷基硫酸鈉(20 %)的緩沖液(100 μL),使MTT甲瓚溶解。然后在微孔板分光光度計(jì)上在490 nm波長(zhǎng)上測(cè)量每個(gè)孔的光密度。半抑制濃度值是通過(guò)繪制復(fù)雜濃度的存活百分比圖并讀取50 %細(xì)胞相對(duì)于對(duì)照存活的濃度來(lái)確定的。每個(gè)實(shí)驗(yàn)至少重復(fù)三次,以得到平均值。HeLa腫瘤細(xì)胞系為本研究的研究對(duì)象。
為了評(píng)估Ru(II)復(fù)合物的凋亡活性,將HeLa Cells 1×106培養(yǎng),用Ru(II)復(fù)合物以半抑制濃度劑量處理24小時(shí),4°C離心。然后用1 mL冰PBS(磷酸鹽緩沖鹽水)洗滌細(xì)胞2次,洗滌2 min。微球在500 μL的HEPES(4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙磺酸)結(jié)合緩沖液中重懸,并在4°C下洗滌5 min。將細(xì)胞重懸于70 μL的HEPES結(jié)合緩沖液中,加入5 μL的膜聯(lián)蛋白V,室溫黑暗下孵育15 min。在室溫黑暗孵育后,用流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析。
細(xì)胞周期阻滯吖啶橙是一種核酸選擇性異色染色劑,可用于細(xì)胞周期的測(cè)定。在PBS中調(diào)整濃度為1×106個(gè)細(xì)胞/mL時(shí)的細(xì)胞懸液。加入緩沖液I(20 mM檸檬酸-磷酸鹽,1 mM EDTA,0.2蔗糖,0.1 % Triton X-100)0.5 mL,4°C,攪拌懸浮并孵育10 min。加入緩沖液II(10 mM檸檬酸磷酸,0.1 M氯化鈉),AO 0.5 mL,4°C,攪拌懸浮。HeLa細(xì)胞用釕配合物處理,并用流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析。
分子對(duì)接研究分子對(duì)接用于預(yù)測(cè)兩個(gè)分子之間形成的分子間復(fù)合物的結(jié)構(gòu)。將小分子與大分子對(duì)接是一項(xiàng)復(fù)雜而困難的任務(wù)。Accelry的發(fā)現(xiàn)工作室軟件在本研究中用于設(shè)計(jì)鉛分子和估計(jì)藥物和蛋白質(zhì)結(jié)合復(fù)合物的對(duì)接相互作用,配體與靶標(biāo)形成的鍵的數(shù)量。對(duì)于受體配體相互作用,本研究使用了發(fā)現(xiàn)工作室的LibDock模塊,LibDock是一種將配體到受體活性結(jié)合位點(diǎn)的高通量算法,也是一種站點(diǎn)特征對(duì)接算法。在運(yùn)行LibDock之前,將配體和蛋白質(zhì)原子應(yīng)用于CHARMM力場(chǎng)。人類(lèi)DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶1受體下載自RCSB PDB(PDB ID-1T8I)的晶體結(jié)構(gòu);利用發(fā)現(xiàn)工作室去除蛋白質(zhì)的所有水分子,穩(wěn)定電荷,填充缺失的殘基,生成側(cè)鏈。該受體應(yīng)具有生物活性和穩(wěn)定狀態(tài)。受體建成后,應(yīng)確定受體內(nèi)的活性位點(diǎn)。受體可能有許多活性位點(diǎn),但應(yīng)該選擇感興趣之一。釕配合物用工具繪制草圖,并用于對(duì)接到目標(biāo)結(jié)合位點(diǎn)。研究了具有較高的得分的結(jié)果姿態(tài),并檢測(cè)了相互作用的配體目標(biāo)復(fù)合物。在虛擬篩選的過(guò)程中,利用評(píng)分函數(shù)來(lái)估計(jì)配體結(jié)合的親和力,以篩選出活性和非活性化合物。
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